La struttura operativa della Fondazione ha il compito di attuare le delibere del Consiglio Generale e del Consiglio di Amministrazione. A capo della struttura risiede il Direttore Generale, affiancato dalla Vice Direttrice Generale.
Riportano direttamente alla Direzione l’Area Finanza e l’Ufficio Affari Legali e Istituzionali.
Il resto della struttura è organizzato in due Divisioni, quella filantropica e quella operativa. Alla Divisione Filantropica riportano l’Area Erogativa, l’Area Comunicazione, l’Ufficio Collezioni d’Arte e l’Osservatorio Dati.
Alla Divisione Operativa riportano l’Area Amministrazione e Contabilità, la Gestione Immobiliare e Sicurezza, i Servizi Informativi e i Servizi Generali.
